Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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