Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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RelnQ60841 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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RelnQ60841 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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RelnQ60841 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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RelnQ60841 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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RelnQ60841 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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RelnQ60841 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RelnQ60841 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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