Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tsr1Q5SWD9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms