Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mdc1Q5PSV9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mdc1Q5PSV9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms