Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ulk4Q3V129 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ulk4Q3V129 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms