Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fchsd2Q3USJ8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms