Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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