Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Arfgef3Q3UGY8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms