Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms