Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms