Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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