Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MitfQ08874 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms