Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms