Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top2aQ01320 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top2aQ01320 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms