Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HmgcrQ01237 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms