Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms