Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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