Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtnP63089 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PtnP63089 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtnP63089 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms