Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd1P62315 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms