Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms