Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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