Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms