Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SagP20443 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SagP20443 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SagP20443 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms