Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcnkO88874 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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