Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2035J3QP87 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms