Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc180J3QNE4 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc180J3QNE4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc180J3QNE4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc180J3QNE4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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