Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms