Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rd3lB2RV38 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rd3lB2RV38 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rd3lB2RV38 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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