Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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