Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Usp36B1AQJ2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp36B1AQJ2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms