Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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