Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf2A3KGV1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf2A3KGV1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms