Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm2A2A7B5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms