Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hdac6Q9Z2V5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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