Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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