Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hmgn5Q9JL35 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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