Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms