Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnn1Q9EQR3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms