Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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