Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sgms2Q9D4B1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sgms2Q9D4B1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sgms2Q9D4B1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sgms2Q9D4B1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sgms2Q9D4B1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sgms2Q9D4B1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms