Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt20Q9D312 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Krt20Q9D312 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Krt20Q9D312 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms