Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pramef12Q9D2F1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pramef12Q9D2F1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pramef12Q9D2F1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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