Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbed3Q9D0L1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbed3Q9D0L1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed3Q9D0L1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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