Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shmt2Q9CZN7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shmt2Q9CZN7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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