Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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