Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ssxb1Q9CPU1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb1Q9CPU1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb1Q9CPU1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb1Q9CPU1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb1Q9CPU1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb1Q9CPU1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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