Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms