Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms