Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cabp4Q8VHC5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cabp4Q8VHC5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms