Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms